Alors qu´au moins dix jours sont nécessaires pour quantifier les champignons capables de produire des mycotoxines comme l´ochratoxine A, l´équipe « Génie des systèmes microbiens » de l´Ensat (École nationale agronomique de Toulouse) a mis au point une méthode de détection et de quantification plus rapide et moins onéreuse. « Notre test est une PCR* quantitative qui vise un gène de la voie de biosynthèse des mycotoxines, explique Ahmed Lebrihi, chercheur et responsable du projet. De la quantité d´ADN détecté, on peut remonter à la quantité de champignons capables de produire les mycotoxines et évaluer ainsi leur potentiel toxinogène et ce, en environ trois heures. » Le test est évalué à environ 10-20 euros contre les 150 euros nécessaires aux analyses microbiologiques de la mycotoxine.

Le champignon Aspergillus carbonarius producteur d´OTA peut être quantifié par le test proposé par Ahmed Lebrihi avant une contamination des baies par la mycotoxine. ©B. Molot/ITV France

Toutefois, « ce test ne remplace pas la méthode de dosage des mycotoxines », prévient Amhed Lebrihi. Les mycotoxines n´apparaissant qu´à partir d´un certain seuil de champignons toxinogènes, le test est en quelque sorte un indicateur. Au delà de ce seuil, le dosage reste de mise. « Notre méthode permet une surveillance du vignoble à moindre coût, conclut-il. Elle peut ainsi faciliter la mise en oeuvre d´un protocole de lutte contre les champignons toxinogènes lorsque le seuil menace d´être atteint. » Un consortium rassemblant une société start-up et les filières céréales, vigne et café s´est constitué afin d´évaluer l´avenir commercial de ce test.
*Réaction de polymérisation en chaîne automatisée qui permet d´amplifier le gène sans avoir recours à des cultures.